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5/9/2016, 7:27 pm 由 PeRl

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5/7/2016, 3:20 pm 由 Lewin Van

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R packages

Bioinformatics club :: Bioinformatics :: R :: R packages

主题

160509

sigclust
用途
主要针对生物信息学数据(高维低样本)产生的聚类结果进行评估，一个基本假设就是数据满足单样本正态分布，计算聚类系数cluster index，进而通过蒙特卡罗随机过程计算该系数的统计学显著性——p值。
根据p值评估聚类的效果以及聚类的结果是否是真实存在的簇，借鉴到二分k均值算法，还可以用来对多类的数据进行聚类操作
优点：计算速度快，特别适合生物信息学中的高维低样本数据
局限：只能对两分类的聚类结果进行评估，如果是多类就必须配对两两比较
函数

代码:
sigclust(x, nsim, nrep=1, labflag=0, label=0, ico...

由 PeRl - 评论: 0 - 浏览: 362

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